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国际石榴园艺学会成功破解石榴基因组:yabo手机版登录

时间:2020-11-05
本文摘要:杂志封面的石榴基因组约为336Mb,组装大小为274Mb,重复序列比例高达512%,共预测30903个基因。之前学术界仍指出石榴属石榴科,袁教授领导的研究团队通过比较基因组分析首次从分子水平确立了石榴的分类学地位,反对将石榴科归为白屈菜属。

基因组

近日,由国际石榴园艺学会会长袁教授带领的研究团队,经过不懈努力,成功破解了石榴基因组,并组装出高质量的基因组草图。相关研究成果于6月14日作为封面文章发表在国际权威期刊《植物生物技术》(IF=7.443)上,标志着我校的研究团队已经超过了该领域的国际领先水平。

我院袁教授、教授、张泰奎博士、美国康奈尔大学费教授、北京百密克公司韩博士为第一作者,袁教授、方延庆教授为通讯合著者。本研究首次从组学的角度确立了石榴的分类地位,系统阐述了石榴基因组重复序列的进化和功能,并结合mRNA蛋白质组学分析阐述了石榴浆果品质组成机制和胚珠发育生物学等科学问题,以期为石榴遗传育种研究获得参考基因组资源。杂志封面的石榴基因组约为336Mb,组装大小为274 Mb,重复序列比例高达51.2%,共预测30903个基因。

之前学术界仍指出石榴属石榴科,袁教授领导的研究团队通过比较基因组分析首次从分子水平确立了石榴的分类学地位,反对将石榴科归为白屈菜属。通过古基因组学的研究,我们发现石榴与其近缘物种巨桉之间存在一个古四倍体事件,双子叶植物之间存在一个古六倍体事件,为进化基因组研究提供了参考基因组资源。石榴重复序列中大的反转座子衍生物的大规模物种特异性拷贝最近再次出现,这与浆果发育过程中的着色和胚珠发育有关。

破解优质石榴的参考基因组,将加强石榴遗传改良的研究,为一般植物比较基因组和进化基因组的研究以及独特浆果品质构成机制的研究获取基因组资源。石榴是一种古老的树种,集生态、经济和社会效益于一体,兼具观赏价值和保健功能。其浆果含有鞣花单宁等抗氧化物质,被誉为超级水果和保健水果。

近年来,石榴作为一种新型果树,在中国、印度、伊朗、美国、西班牙、以色列、土耳其、意大利、俄罗斯、南非、智利等国家广泛种植,发展势头迅猛。也是国家规划的特色经济林树种之一。袁教授团队的研究成果将对石榴品质的提高和国际石榴产业的发展产生深远的影响。

石榴基因组重复序列LARD家族的进化与传递研究得到了国家自然科学基金、江苏省高校优势学科建设项目、南京林业大学高层次人才研究启动基金项目、江苏省普通高校研究生研究创新计划项目、南京林业大学优秀博士学位论文创新基金项目和美国国家科学基金的资助。


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